RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SNX24	Q9Y343	169 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RELN	P78509	3460 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		H0YIG0	161 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HAT1	O14929	419 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CYC1	P08574	325 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CSNK1G2	P78368	415 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	KLC1	Q07866	573 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NAE1	Q13564	534 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IGFBP7	Q16270	282 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	AMER3	Q8N944	861 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ATL1	Q8WXF7	558 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FBXL8	Q96CD0	374 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HAUS8	Q9BT25	410 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DRC3	Q9H069	523 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	10.92	□□□□□ -0.66	5e-8	■□□□□ 9.8
CS-223	ENST00000551137	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ESPL1	Q14674	2120 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	POLE	Q07864	2286 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		A6NL46	340 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	P2RX6	O15547	441 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	GSTA2	P09210	222 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MLLT10	P55197	1068 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CDKL1	Q00532	357 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CAV1	Q03135	178 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SBSN	Q6UWP8	590 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ADCK2	Q7Z695	626 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	C17orf64	Q86WR6	236 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		Q8NA96	180 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TM9SF4	Q92544	642 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	C3orf18	Q9UK00	162 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IDS	B3KWA1	339 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RAD51C	O43502	376 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HP	P00738	406 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	C1QA	P02745	245 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ACPP	P15309	386 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CASQ1	P31415	396 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TAS2R39	P59534	338 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RBBP7	Q16576	425 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	VWA2	Q5GFL6	755 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		Q6ZS92	163 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		10.9	□□□□□ -0.66

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