RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SNF8Q96H20 258 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ARL15Q9NXU5 204 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ZFATQ9P243 1243 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PDE10AQ9Y233 779 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 VWA7Q9Y334 891 aa16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 IDSB3KWA1 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MYBL2P10244 700 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ICAM2P13598 275 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NAE1Q13564 534 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 VWA2Q5GFL6 755 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ISLR2Q6UXK2 745 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 LMF1Q96S06 567 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.08■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 DYTNA2CJ06 578 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 H0YIG0 161 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 BANF1O75531 89 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 WFS1O76024 890 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SLC26A3P40879 764 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ITGA8P53708 1063 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MSS51Q4VC12 460 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 DUPD1Q68J44 220 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 LCTLQ6UWM7 567 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 Q6ZS92 163 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CREG2Q8IUH2 290 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 Q8NA96 180 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 VPS39Q96JC1 886 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CNDP1Q96KN2 507 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MASP2O00187 686 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ALOX12BO75342 701 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MED26O95402 600 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CYC1P08574 325 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 UQCRFS1P47985 274 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CCR8P51685 355 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SLC12A2P55011 1212 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CDKN2DP55273 166 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MGAT5Q09328 741 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CALCOCO2Q13137 446 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TLR1Q15399 786 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ATG9BQ674R7 924 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 PLD3Q8IV08 490 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 PRR7Q8TB68 274 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 TTI1O43156 1089 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SERPINA7P05543 415 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 GP1BBP13224 206 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 SAT1P21673 171 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 IVDP26440 423 aa16.05■□□□□ 0.16
CASP9-211ENST00000546969 GABRB3P28472 473 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms