RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GIPC3Q8TF64 312 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ALG2Q9H553 416 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CENPMQ9NSP4 180 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 H7BY64 318 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SCELO95171 688 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PBX1P40424 430 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP8P85298 464 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SRYQ05066 204 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TMCO6Q96DC7 493 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CMKLR1Q99788 373 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PIGUQ9H490 435 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 FZD4Q9ULV1 537 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQ72 361 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CIB4A0PJX0 185 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RFXAPO00287 272 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PLIN3O60664 434 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TCF4P15884 667 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PFKLP17858 780 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CD6P30203 668 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CACNA2D1P54289 1103 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ARG2P78540 354 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DSC1Q08554 894 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DMPKQ09013 629 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 KLF10Q13118 480 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RIPK1Q13546 671 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RAET1LQ5VY80 246 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GPAT4Q86UL3 456 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 LPGAT1Q92604 370 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 KCNJ9Q92806 393 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NPY6RQ99463 290 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PRODH2Q9UF12 536 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MANBAO00462 879 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SNPHO15079 494 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SCO2O43819 266 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJA2O60884 412 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 IMPDH1P20839 514 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PRPS1L1P21108 318 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 HERC3Q15034 1050 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 QPCTQ16769 361 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SCAMP4Q969E2 229 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 OR51B5Q9H339 312 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RMI1Q9H9A7 625 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GBAP04062 536 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TGFBR2P37173 567 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SUOXP51687 545 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 HMGCS1Q01581 520 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZSR6 202 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TREML1Q86YW5 311 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GPR65Q8IYL9 337 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TOX2Q96NM4 488 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 LGR4Q9BXB1 951 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GLS2Q9UI32 602 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 GLOD5A6NK44 160 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NCK1P16333 377 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 CHN2P52757 468 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 OGDHQ02218 1023 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRCAPQ14761 206 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 MREGQ8N565 214 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 NAXEQ8NCW5 288 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms