RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-215ENST00000532032 SIX4Q9UIU6 781 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 E2F8A0AVK6 867 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 FAM149AA5PLN7 773 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MEI4A8MW99 385 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ALG1L2C9J202 215 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MED7O43513 233 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ITM2AO43736 263 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TULP3O75386 442 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 KRT38O76015 456 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 KLHL2O95198 593 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 OLFM2O95897 454 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SERPINE1P05121 402 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 UQCRBP14927 111 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 VCLP18206 1134 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ITGAXP20702 1163 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TGM2P21980 687 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CNTFP26441 200 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 OXTRP30559 389 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MATKP42679 507 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MAGEA12P43365 314 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 LHX1P48742 406 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ASPHQ12797 758 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 NAB1Q13506 487 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ITGA9Q13797 1035 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 PDK2Q15119 407 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 RAB6CQ53S08 254 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 LGSNQ5TDP6 509 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 FAM171BQ6P995 826 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 C4orf22Q6V702 233 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 RFX8Q6ZV50 586 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CTAGE3PQ8IX95 158 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CHPFQ8IZ52 775 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 HSPH1Q92598 858 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 WBP1Q96G27 269 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ZNF560Q96MR9 790 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 OLFM3Q96PB7 478 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TWNKQ96RR1 684 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SORT1Q99523 831 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 NDNQ99608 321 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 PKMYT1Q99640 499 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 EBF4Q9BQW3 602 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CENPKQ9BS16 269 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CLMPQ9H6B4 373 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 IL21RQ9HBE5 538 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 TMCO1Q9UM00 188 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 CPQQ9Y646 472 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 WDR81Q562E7 1941 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 LAMA5O15230 3695 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 H7C0C1 242 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 M0QYG6 137 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-215ENST00000532032 PLK4O00444 970 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms