RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SUPT7LO94864 414 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 MLYCDO95822 493 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OTCP00480 354 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CCL4P13236 92 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ITIH1P19827 911 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HNF4AP41235 474 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 MAPK10P53779 464 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GPS2Q13227 327 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CHIT1Q13231 466 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KCNAB1Q14722 419 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CATSPEREQ5SY80 951 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 LIPJQ5W064 366 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ARL8AQ96BM9 186 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SELENOSQ9BQE4 189 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NTMT1Q9BV86 223 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NT5DC2Q9H857 520 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ACTR8Q9H981 624 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HAT1O14929 419 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 BIRC5O15392 142 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM13O60858 407 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HGFP14210 728 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 EPORP19235 508 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CD82P27701 267 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 AHRP35869 848 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CCNG1P51959 295 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GPR19Q15760 415 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP157Q5JU67 520 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TLDC1Q6P9B6 456 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TRMOQ9BU70 441 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NLNQ9BYT8 704 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0J9YVX5 310 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NVLO15381 856 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OR2B3O76000 313 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 WFS1O76024 890 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINB1P30740 379 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINB5P36952 375 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CLCQ05315 142 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TTMPQ5BVD1 217 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GRHL2Q6ISB3 625 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB9Q96C00 473 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 REPS1Q96D71 796 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLC46A1Q96NT5 459 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OR2A5Q96R48 311 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DRC3Q9H069 523 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 MED4Q9NPJ6 270 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 THSD1Q9NS62 852 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SRPK3Q9UPE1 567 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC14BA6NHZ5 514 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PRAMEF10O60809 474 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TNFSF15O95150 251 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CLDN9O95484 217 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 BPGMP07738 259 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HBQ1P09105 142 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DHRS4L1P0CG22 281 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HPDP32754 393 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINB4P48594 390 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 EMP3P54852 163 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ERVPABLB-1P60509 514 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 LCP2Q13094 533 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DOC2AQ14183 400 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB110Q30KQ9 67 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO42Q6P3S6 717 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FRMD7Q6ZUT3 714 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf107Q8IVU9 208 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 MFSD9Q8NBP5 474 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF382Q96SR6 550 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB26Q9HCK0 441 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SPTBP11277 2137 aa17.89■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH3A1P30838 453 aa17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms