RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402		A0A1W2PPK0	400 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TRBC2	A0A5B9	178 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402		K7EQD1	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	BCL2L11	O43521	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TIMM44	O43615	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	AHCYL1	O43865	530 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RPS6KA5	O75582	802 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	STARD3NL	O95772	234 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CAPN2	P17655	700 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	PDHA2	P29803	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CAPG	P40121	348 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CETN2	P41208	172 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	OPCML	Q14982	345 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	IQCH	Q86VS3	1027 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC89	Q8N998	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	PROX1	Q92786	737 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ACTL8	Q9H568	366 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SLC1A7	O00341	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SURF4	O15260	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ATP6AP2	O75787	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ITIH1	P19827	911 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	AADAC	P22760	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	DCDC1	P59894	354 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	COX10	Q12887	443 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SDCBP2	Q9H190	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	MYL6B	P14649	208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CD27	P26842	260 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CAPZA2	P47755	286 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RAB28	P51157	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RALGDS	Q12967	914 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	PEX6	Q13608	980 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	LETM2	Q2VYF4	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	KRT39	Q6A163	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	FAM131B	Q86XD5	332 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	HDAC11	Q96DB2	347 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ATF6B	Q99941	703 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	IL36A	Q9UHA7	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	SHISA7	A6NL88	538 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402		A8MXK9	166 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ACSL3	O95573	720 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	AZU1	P20160	251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	PTMS	P20962	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	HSD17B3	P37058	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	DLK1	P80370	383 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	DHODH	Q02127	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	RBPJ	Q06330	500 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	BECN1	Q14457	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CTR9	Q6PD62	1173 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MATR3-223	ENST00000514402	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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