RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 OR6C1Q96RD1 312 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 TAAR9Q96RI9 348 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 DDA1Q9BW61 102 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 PISDQ9UG56 409 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 RARRES3Q9UL19 164 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 CACNA1AO00555 2505 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN3-202ENST00000511191 A0A0J9YVX5 310 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MLYCDO95822 493 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 OTCP00480 354 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ITIH1P19827 911 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CD22P20273 847 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ETV5P41161 510 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 HNF4AP41235 474 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SCTRP47872 440 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CDH13P55290 713 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SHC2P98077 582 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 FOXM1Q08050 763 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LCP2Q13094 533 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TRAF3Q13114 568 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 KRT78Q8N1N4 520 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ZPBPQ9BS86 351 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MECRQ9BV79 373 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MED4Q9NPJ6 270 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 GSTM2P28161 218 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 AHRP35869 848 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 BCL6P41182 706 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 GABREP78334 506 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TCTE1Q5JU00 501 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 PLD3Q8IV08 490 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LSMEM2Q8N112 164 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 OR1L3Q8NH93 324 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CNDP1Q96KN2 507 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF382Q96SR6 550 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TRMOQ9BU70 441 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ACTR8Q9H981 624 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SPTBN2O15020 2390 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 FEZF1A0PJY2 475 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 H0YGG7 62 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 H3BQF6 201 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 AGRPO00253 132 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 NPHS1O60500 1241 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CLDN9O95484 217 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 SERPINB5P36952 375 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CCNG1P51959 295 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ITGA1P56199 1179 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CYP4F3Q08477 520 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 CFAP157Q5JU67 520 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 HHATQ5VTY9 493 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTN3-202ENST00000511191 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms