RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 DYRK4Q9NR20 520 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C1orf109Q9NX04 203 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 VPS4AQ9UN37 437 aa13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 THSD7BQ9C0I4 1608 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 A0A0G2JMP0 313 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 A0A0X1KG70 313 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NDUFS3O75489 264 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SNX4O95219 450 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 KLKB1P03952 638 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ITGA2P17301 1181 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HMGCS1Q01581 520 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ABRAXAS2Q15018 415 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DUSP7Q16829 419 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 EFHBQ8N7U6 833 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ANGPTL6Q8NI99 470 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RABL2BQ9UNT1 228 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 H3BNC9 293 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CBX4O00257 560 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SYN3O14994 580 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 WDR47O94967 919 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RETP07949 1114 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 IRF1P10914 325 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TIE1P35590 1138 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MAPKAPK2P49137 400 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 IRF3Q14653 427 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PTPRNQ16849 979 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MGME1Q9BQP7 344 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GBF1Q92538 1859 aa13.07□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CBLP22681 906 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HOXA9P31269 272 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC19A1P41440 591 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RGS6P49758 472 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF6Q15052 776 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC7A6Q92536 515 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R16Q9NYV7 291 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 E5RI56 91 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP33O14559 1287 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SEC22BO75396 215 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCNYL3P0C7X3 344 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RFX2P48378 723 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HK3P52790 923 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPR17Q13304 367 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPNMBQ14956 572 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 BAK1Q16611 211 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FUT10Q6P4F1 479 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCDC190Q86UF4 302 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 AMIGO1Q86WK6 493 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCDC120Q96HB5 630 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CASD1Q96PB1 797 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCDC32Q9BV29 185 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 UCK2Q9BZX2 261 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DERL2Q9GZP9 239 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ABCG8Q9H221 673 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MAGIXQ9H6Y5 334 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 REEP1Q9H902 201 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CDK2AP1O14519 115 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ACSL4O60488 711 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NBNO60934 754 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SCO1O75880 301 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN9O75954 239 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF12O95522 483 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PTHP01270 115 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SNX20Q7Z614 316 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms