RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS58Q8IYP2 241 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR6C4Q8NGE1 309 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ECHDC3Q96DC8 303 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FAM129BQ96TA1 746 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 POT1Q9NUX5 634 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CALML5Q9NZT1 146 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CA5BQ9Y2D0 317 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SUV39H1O43463 412 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GABRB3P28472 473 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GMPRP36959 345 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 BCL7AQ4VC05 210 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM35AQ53FP2 167 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf136Q5SQH8 315 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9A6Q92581 669 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CNPPD1Q9BV87 410 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PELI2Q9HAT8 420 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SNTNA6NMZ2 147 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 YKT6O15498 198 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 JMJD7P0C870 316 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KCNC1P48547 511 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 XIAPP98170 497 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FRS2Q8WU20 508 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NAT6Q93015 286 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KCNC2Q96PR1 638 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TLR4O00206 839 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GSC2O15499 205 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PRMT3O60678 531 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 IL9P15248 144 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ETV4P43268 484 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCR10P46092 362 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R50P59544 299 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC34A1Q06495 639 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CEP76Q8TAP6 659 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AP3D1O14617 1153 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 G6PDP11413 515 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GCAP28676 217 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PDHA2P29803 388 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DLG1Q12959 904 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CAMK1Q14012 370 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LCTLQ6UWM7 567 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 USP53Q70EK8 1073 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NLRP8Q86W28 1048 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PDPRQ8NCN5 879 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AGAP11Q8TF27 550 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SCN3BQ9NY72 215 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DUXAA6NLW8 204 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AREL1O15033 823 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AQP9O43315 295 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DFNA5O60443 496 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF15O94989 841 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf105O95561 183 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PDYNP01213 254 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CTSLP07711 333 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ATP4BP51164 291 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CLCN7P51798 805 aa7.98□□□□□ -1.13
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