RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 LINGO1Q96FE5 620 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MSANTD3Q96H12 275 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SCLYQ96I15 445 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN19P0C672 248 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 OR1D2P34982 312 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ST3GAL4Q11206 333 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DOK6Q6PKX4 331 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM203Q969S6 136 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A4O43246 635 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CA12O43570 354 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CTPS1P17812 591 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CSRP3P50461 194 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CCL23P55773 120 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GBX1Q14549 363 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 AFMIDQ63HM1 303 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CPZQ66K79 652 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PJA1Q8NG27 643 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf74Q96LT6 269 aa15.73■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PTHP01270 115 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PGRP06401 933 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TGFBR2P37173 567 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 UGT2B15P54855 530 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 AADATQ8N5Z0 425 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf109Q9NX04 203 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TET1Q8NFU7 2136 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN24A6NM45 220 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SCN1BQ07699 218 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DSC1Q08554 894 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MYO7AQ13402 2215 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 BAK1Q16611 211 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 FUT10Q6P4F1 479 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP8Q86W28 1048 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TSPEARQ8WU66 669 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 COQ8BQ96D53 544 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.72■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLC16A6O15403 523 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 NBNO60934 754 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 S100A3P33764 101 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA7P48741 367 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SREBF2Q12772 1141 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 NPRL3Q12980 569 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf48Q96LL4 319 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 FRMD6Q96NE9 622 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SNX7Q9UNH6 387 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0X1KG70 313 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 M0R082 166 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CDK2AP1O14519 115 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 KERAO60938 352 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CKMT1AP12532 417 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TIE1P35590 1138 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 IL10RBQ08334 325 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RAET1EQ8TD07 263 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF225Q9UK10 706 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SCN4AP35499 1836 aa15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms