RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OGDHQ02218 1023 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTBD16Q32M84 506 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPIN4Q56A73 249 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNA7Q96RP8 456 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZD8Q9H461 694 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLE4Q9NR33 117 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf189Q5VU69 101 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIPEPQ99797 713 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 S100A2P29034 98 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPIP34949 423 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC13A2Q13183 592 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAPTM4AQ15012 233 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOA3Q8NG57 546 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RDH8Q9NYR8 311 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRRDQ9UH36 339 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPB11Q9Y547 144 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MANBAO00462 879 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRG2Q64ET8 278 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAQR7Q86WK9 346 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRG2BQ96QU4 278 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMIM30A4D0T7 59 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 L7N2F9 121 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RB1P06400 928 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSKP41240 450 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR12D2P58182 307 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C12orf66Q96MD2 445 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP29Q9HBJ7 922 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH3D21A4FU49 640 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALPIP09923 528 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAG3P18627 525 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GGT5P36269 586 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLCN7P51798 805 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGDP52209 483 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT13Q86X67 352 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C14orf105Q9NVL8 296 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM189A1O60320 539 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APOL3O95236 402 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLK1P06870 262 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATS1Q496A3 300 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 J3QLW9 94 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DPB1P04440 258 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF19P17023 458 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB1P25685 340 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK6Q00534 326 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKCDQ05655 676 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF208O43345 1280 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CH25HO95992 272 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF20P17024 532 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCAR3P49019 387 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMBIM6P55061 237 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPA4Q13156 261 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITFG2Q969R8 447 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ILVBLA1L0T0 632 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUXAA6NLW8 204 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM170BA6NMN3 283 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TYROBPO43914 113 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLITRK5O94991 958 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCR8P51685 355 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APLP1P51693 650 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGAP1Q07960 439 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms