RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PROZP22891 400 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2F1P24903 491 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMA5P28066 241 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SSTP61278 116 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ISL1P61371 349 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MANEAQ5SRI9 462 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf25Q5T742 122 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4A47Q6IF82 309 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPPQ6IPU0 288 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TDHQ8IZJ6 230 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SMYD1Q8NB12 490 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RDM1Q8NG50 284 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MTBPQ96DY7 904 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C3orf30Q96M34 536 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TAAR6Q96RI8 345 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 COQ7Q99807 217 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MIS12Q9H081 205 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX6Q9UNH7 406 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0U1RQJ8 604 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0U1RRA0 63 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LILRA5A6NI73 299 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 AP3B1O00203 1094 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNHIT1O43257 154 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG6O75602 509 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 BAG3O95817 575 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GM2AP17900 193 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GLIPR1P48060 266 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CCZ1BP86790 482 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.514e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-209ENST00000473406 GPS2Q13227 327 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GPM6BQ13491 265 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RIPK1Q13546 671 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 BOLA3Q53S33 107 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC183Q5T5S1 534 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PACS1Q6VY07 963 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM139Q8IV31 216 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FCGR1BQ92637 280 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 DPF1Q92782 380 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM19Q96HH6 336 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NDNQ99608 321 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGQQ9BRB3 760 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NTMT1Q9BV86 223 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB33BQ9H082 229 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SDCBP2Q9H190 292 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM49BA6NDI0 452 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A2O15244 555 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CHADO15335 359 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MID1O15344 667 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LANCL1O43813 399 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TFAP2AP05549 437 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CALCBP10092 127 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB41P11171 864 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GOT1P17174 413 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRA2P23416 452 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms