RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469334.5

SMARCE1-207, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 2,128 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-207ENST00000469334 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 REEP1Q9H902 201 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 HPF1Q9NWY4 346 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ASB4Q9Y574 426 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SBF1O95248 1867 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 A0A1W2PPL8 197 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 HYKKA2RU49 373 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SH3D21A4FU49 640 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 F8W036 122 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 F8W810 466 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SGK494L7N484 410 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PMPCBO75439 489 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SNAPC5O75971 98 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SEMG1P04279 462 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 NFICP08651 508 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ACSM4P0C7M7 580 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ODC1P11926 461 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CAP2P40123 477 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TPI1P60174 286 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PPP3R1P63098 170 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SCAPQ12770 1279 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 KIAA0040Q15053 153 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SSX1Q16384 188 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TMEM107Q6UX40 140 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 NETO2Q8NC67 525 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 OR2T11Q8NH01 316 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 EXT2Q93063 718 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 YIPF5Q969M3 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ULK4Q96C45 1275 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TTPALQ9BTX7 342 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 FICDQ9BVA6 458 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SIK2Q9H0K1 926 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MED28Q9H204 178 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ABCB9Q9NP78 766 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ZNF302Q9NR11 478 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 EMC3Q9P0I2 261 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 A0A1B0GVI7 797 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 WNT9AO14904 365 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 INPPL1O15357 1258 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CHP2O43745 196 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 OLFM2O95897 454 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 EPHA2P29317 976 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ADRA1AP35348 466 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 GZMMP51124 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 EPHA5P54756 1037 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CDKN2DP55273 166 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ABHD18Q0P651 414 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 RPA4Q13156 261 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 KLHL22Q53GT1 634 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 DCAF15Q66K64 600 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TRILQ7L0X0 811 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 NETO1Q8TDF5 533 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 UCN3Q969E3 161 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 NT5C3BQ969T7 300 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 MYLPFQ96A32 169 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 WBP1Q96G27 269 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 FAM129BQ96TA1 746 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 C12orf57Q99622 126 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 CD244Q9BZW8 370 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 ACTL8Q9H568 366 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 SP110Q9HB58 689 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-207ENST00000469334 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms