RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM74Q96NL1 305 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 SORT1Q99523 831 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CCT7Q99832 543 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 KITP10721 976 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 PCNAP12004 261 aa9□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 BCL6P41182 706 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 SEPHS1P49903 392 aa9□□□□□ -0.97
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