RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FFAR3O14843 346 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH17O14917 1159 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 GPR42O15529 346 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 JRKO75564 520 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 FTH1P02794 183 aa6.24□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 OR56A5P0C7T3 313 aa6.23□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 CDSNQ15517 529 aa6.23□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 NR4A3Q92570 626 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 C10orf90Q96M02 699 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MIPEPQ99797 713 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CRB3Q9BUF7 120 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 A0A0U1RQJ8 604 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 HYKKA2RU49 373 aa6.22□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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HOXD8-202ENST00000429017 TNFSF10P50591 281 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 RWDD2BP57060 319 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ACVR1Q04771 509 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 ART3Q13508 389 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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