RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 LAPTM5Q13571 262 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf27AQ580R0 203 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SFT2D3Q587I9 215 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SGO1Q5FBB7 561 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 XKR6Q5GH73 641 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SYT12Q8IV01 421 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LILRA2Q8N149 483 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PHC3Q8NDX5 983 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TRPV3Q8NET8 790 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2E3Q969T4 207 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 EME1Q96AY2 570 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 WDR34Q96EX3 536 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 COX14Q96I36 57 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ITCHQ96J02 903 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC115Q96NT0 180 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PKP4Q99569 1192 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AG1Q9H205 316 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 YY1AP1Q9H869 796 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ITM2BQ9Y287 266 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.7□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 A0A096LPI6 279 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 A6NHS1 94 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF839A8K0R7 811 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ARPC2O15144 300 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PLXNA2O75051 1894 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CFIP05156 583 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 AMD1P17707 334 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ITPKAP23677 461 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FASP25445 335 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 S100A3P33764 101 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HOXD12P35452 270 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ASMTP46597 345 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TRPC1P48995 793 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 AQP4P55087 323 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FOLH1Q04609 750 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MESP2Q0VG99 397 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CNTN1Q12860 1018 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 NAE1Q13564 534 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 DOC2AQ14183 400 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ATG9BQ674R7 924 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PNCKQ6P2M8 343 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CEP76Q8TAP6 659 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 GTF2H4Q92759 462 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 PYCR2Q96C36 320 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 OR52E6Q96RD3 313 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.69□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.68□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.68□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM202A6NGA9 273 aa9.68□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 C9JVG2 144 aa9.68□□□□□ -0.86
POLR1A-204ENST00000424089 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms