RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAUS1Q96CS2 278 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7C0C1 242 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAN1A2O60476 641 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFEBP19484 476 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5OP48047 213 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB561P49447 251 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTK6Q13882 451 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NR1I3Q14994 352 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMED2Q15363 201 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARSKQ6UWY0 536 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQCDQ96DY2 449 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARD6Q9BX69 1037 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP6Q13023 2319 aa15.57■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMTNL1A8MU46 457 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YIG0 161 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDC80O14777 642 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAF1P04049 648 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXN2P32314 431 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNFP41002 786 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP107P57740 925 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC18A3Q16572 532 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAQR7Q86WK9 346 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC20BQ86Y33 519 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAR4Q99677 370 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SARGQ9BW04 601 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN2AQ99250 2005 aa15.56■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPV9 198 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPOPO43791 374 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1I1O60431 355 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMA3P25788 255 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIR2DL3P43628 341 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLX5P56178 289 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPARCL1Q14515 664 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAOXQ6QHF9 649 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPRMLQ8N4K4 120 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2A5Q96R48 311 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSTPIP1O43586 416 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HS6ST1O60243 411 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf105O95561 183 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPINC1P01008 464 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOC2P02655 101 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AOAHP28039 575 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXC12P31275 282 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RELAQ04206 551 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POU6F1Q14863 301 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCGF5Q86SE9 256 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOPNLQ96NB1 174 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.54■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROH6A6NGR9 719 aa15.53■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR51F1A6NGY5 319 aa15.53■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms