RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 VWA7Q9Y334 891 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 E7ENX8 843 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAM10O14672 748 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN6O43657 245 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KDELR3O43731 214 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GMDSO60547 372 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5F1O95221 314 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CXCL10P02778 98 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C8BP07358 591 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRNB2P17787 502 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AGXTP21549 392 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 S100A3P33764 101 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACVRL1P37023 503 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIA3P42263 894 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CDKN2BP42772 138 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NCS1P62166 190 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDH1Q08174 1060 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LMAN2Q12907 356 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CTBP1Q13363 440 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PFKFB4Q16877 469 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PGS1Q32NB8 556 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR33Q49SQ1 333 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 XKR6Q5GH73 641 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CHSY3Q70JA7 882 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX20Q7Z614 316 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 COMMD2Q86X83 199 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LINGO1Q96FE5 620 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf74Q96LT6 269 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM246Q9BRR3 403 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALG9Q9H6U8 611 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MALT1Q9UDY8 824 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PRQ8 180 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB19A4D1S5 217 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FFAR2O15552 330 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2B3O76000 313 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNA21P01568 189 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TFEBP19484 476 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LCN1P31025 176 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT1A5P35504 534 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GRIA4P48058 902 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLK1P53350 603 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PTP4A2Q12974 167 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SERINC3Q13530 473 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM189A2Q15884 450 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR149Q86SP6 731 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM129CQ86XR2 697 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM25Q86YD3 366 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR65Q8IYL9 337 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPARTQ8N0X7 666 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2T3Q8NH03 318 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 USP7Q93009 1102 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM203Q969S6 136 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LMLNQ96KR4 655 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT27Q9BW83 186 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TPK1Q9H3S4 243 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SIX2Q9NPC8 291 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DTLQ9NZJ0 730 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HCSTQ9UBK5 93 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms