RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAP2K4P45985 399 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNLIPRP1P54315 467 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NRG3P56975 720 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIAA1024LP59773 190 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SYNE4Q8N205 404 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF276Q8N554 614 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 YIPF5Q969M3 257 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACCSQ96QU6 501 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCDHB18PQ96TA0 734 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SRRDQ9UH36 339 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GGT3PA6NGU5 568 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 INSIG1O15503 277 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNAB3O43448 404 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 KDELR3O43731 214 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PEX2P28328 305 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GGT2P36268 569 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN7P41732 249 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAP2K3P46734 347 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERVFC1P60507 584 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRC41Q15345 812 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CADM3Q8N126 398 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR151Q8TDV0 419 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RRAGCQ9HB90 399 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM260Q9NX78 707 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 USP18Q9UMW8 372 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC17A3O00476 420 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 JUPP14923 745 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCGF2P35227 344 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 BCAT1P54687 386 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CAMK2DQ13557 499 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C1orf189Q5VU69 101 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARMCX2Q7L311 632 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FJX1Q86VR8 437 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NPAS3Q8IXF0 933 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AKT1S1Q96B36 256 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PYCR2Q96C36 320 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 C14orf79Q96F83 325 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 AIPO00170 330 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TYROBPO43914 113 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRPSAP2O60256 369 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 DIRAS1O95057 198 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP17A1P05093 508 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 BGNP21810 368 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LHCGRP22888 699 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GIFP27352 417 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CXCR5P32302 372 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 GAGE1Q13065 139 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLN3Q13286 438 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FUT10Q6P4F1 479 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LMBR1LQ6UX01 489 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 NIPA2Q8N8Q9 360 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 LCN9Q8WX39 176 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 COQ10AQ96MF6 247 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IDI2Q9BXS1 227 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL26Q9NPH9 171 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TIGARQ9NQ88 270 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 HMSDA8MTL9 139 aa3.35□□□□□ -1.87
PKHD1L1-201ENST00000378402 TLR4O00206 839 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms