RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378156.8

NPHP4-201, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP4, Length 4,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-201ENST00000378156 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CD1DP15813 335 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 E2F2Q14209 437 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZBED5Q49AG3 693 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 UNC50Q53HI1 259 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OAFQ86UD1 273 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CADM2Q8N3J6 435 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MARCH7Q9H992 704 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 AMBNQ9NP70 447 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FAM172BPA6NC97 362 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TFPIP10646 304 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GM2AP17900 193 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FOXM1Q08050 763 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GPR153Q6NV75 609 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 USP43Q70EL4 1123 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FMO3P31513 532 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ARHGDIBP52566 201 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 NFATC2Q13469 925 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SPIN4Q56A73 249 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 EXO5Q9H790 373 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ABCB9Q9NP78 766 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IL23AQ9NPF7 189 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TAC3Q9UHF0 121 aa14.6□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LEFTY1O75610 366 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MPIP34949 423 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CLIC1O00299 241 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ITGB1P05556 798 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 EBLN1P0CF75 366 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 MAGEA6P43360 314 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SLC13A2Q13183 592 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GRM2Q14416 872 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SCAMP4Q969E2 229 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 RGMAQ96B86 450 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OR14I1A6ND48 311 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IL7RP16871 459 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 IGFALSP35858 605 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 BDKRB1P46663 353 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 VEGFBP49765 207 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CARTPTQ16568 116 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 GPR65Q8IYL9 337 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SORT1Q99523 831 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 AURKAO14965 403 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 BNIP3Q12983 259 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.58□□□□□ -0.07
NPHP4-201ENST00000378156 A0A1W2PQ72 361 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 MANBAO00462 879 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 KMOO15229 486 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 HNF1BP35680 557 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 ACADVLP49748 655 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 RAB33AQ14088 237 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 NRG4Q8WWG1 115 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 TSC22D1Q15714 1073 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 EOGTQ5NDL2 527 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 COX18Q8N8Q8 333 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 SAMD11Q96NU1 681 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.58□□□□□ -0.08
NPHP4-201ENST00000378156 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms