RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 RNF44Q7L0R7 432 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PDIK1LQ8N165 341 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SMPDL3AQ92484 453 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MARVELD3Q96A59 401 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 FAM136AQ96C01 138 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 COPG2Q9UBF2 871 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TRPC4Q9UBN4 977 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MED16Q9Y2X0 877 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CSAG2Q9Y5P2 127 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.38□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 E5RI56 91 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PRSS44E7EML9 344 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SMAPO00193 183 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CTSVO60911 334 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CATP04040 527 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SERPINA7P05543 415 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 STSP08842 583 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 GABRB3P28472 473 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TNFRSF8P28908 595 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MPP1Q00013 466 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CBLBQ13191 982 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 DSG2Q14126 1118 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 NDUFA9Q16795 377 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 C1QL3Q5VWW1 255 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 FJX1Q86VR8 437 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CFAP36Q96G28 342 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SLC30A3Q99726 388 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 DPH7Q9BTV6 452 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 WHRNQ9P202 907 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.37□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 IDSB3KWA1 339 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 E7ESA3 106 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 E2F3O00716 465 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ZG16O60844 167 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 BMP10O95393 424 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MLYCDO95822 493 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ESR1P03372 595 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PRR35P0CG20 571 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CHRM3P20309 590 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PSMB5P28074 263 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ARL4CP56559 192 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 SLC7A5Q01650 507 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TTLL9Q3SXZ7 439 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ATG9BQ674R7 924 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 FRMPD2BQ6IN97 320 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TMEM207Q6UWW9 146 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 GFRALQ6UXV0 394 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 OR9A1PQ8NGU1 263 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 DNAJB8Q8NHS0 232 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 HAS2Q92819 552 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 C8orf44Q96CB5 159 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 NAT9Q9BTE0 207 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 NFS1Q9Y697 457 aa13.36□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 OR2A25A4D2G3 310 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 H0YGG7 62 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 KLHL18O94889 574 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 RASAL1O95294 804 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TTC4O95801 387 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 AHSGP02765 367 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 EZRP15311 586 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 AVPR1BP47901 424 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TNFSF10P50591 281 aa13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CITED1-202ENST00000373619 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms