RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 BTBD16Q32M84 506 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ACER2Q5QJU3 275 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 H3F3CQ6NXT2 135 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TUBA3EQ6PEY2 450 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM139Q8IV31 216 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CEP97Q8IW35 865 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MDS2Q8NDY4 140 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 OR9A1PQ8NGU1 263 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 OR9A4Q8NGU2 314 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MAGED4Q96JG8 741 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 FOPNLQ96NB1 174 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 BIRC8Q96P09 236 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PANX3Q96QZ0 392 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MACROD1Q9BQ69 325 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ABCF3Q9NUQ8 709 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SPATA7Q9P0W8 599 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TAC3Q9UHF0 121 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.67□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA8KD6RF30 607 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 E7EVH7 732 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA8TH3BQL2 631 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 HAT1O14929 419 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 KPNA5O15131 536 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TTI1O43156 1089 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.5
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN12O43309 604 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 DIAPH2O60879 1101 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 VPS26AO75436 327 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFS3O75489 264 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 FTCDO95954 541 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 IFNB1P01574 187 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MYBL2P10244 700 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 NMBRP28336 390 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TLE4Q04727 773 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 GBX1Q14549 363 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 LONRF1Q17RB8 773 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ACSBG2Q5FVE4 666 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ICE2Q659A1 982 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CES3Q6UWW8 571 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SPNS3Q6ZMD2 512 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CDH24Q86UP0 819 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CRLF3Q8IUI8 442 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SMPDL3AQ92484 453 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC138Q96M89 665 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PKP4Q99569 1192 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RAB6BQ9NRW1 208 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TREX1Q9NSU2 369 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PCYOX1Q9UHG3 505 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 TEKT2Q9UIF3 430 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 AMFRQ9UKV5 643 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.66□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ADAM10O14672 748 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ASNA1O43681 348 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 LIASO43766 372 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 APRTP07741 180 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ARNTP27540 789 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 FDFT1P37268 417 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 CSNK1G2P78368 415 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 OR1C1Q15619 314 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL38Q2WGJ6 581 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 KRTCAP3Q53RY4 240 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PCID2Q5JVF3 399 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RNFT1Q5M7Z0 435 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PLAG1Q6DJT9 500 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RAD9BQ6WBX8 426 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PEX26Q7Z412 305 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 DOLPP1Q86YN1 238 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SIAH3Q8IW03 269 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 AGAP11Q8TF27 550 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 METTL21AQ8WXB1 218 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 C14orf79Q96F83 325 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 SCMH1Q96GD3 660 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.65□□□□□ -0.38
TTPAL-203ENST00000372906 FRMD6Q96NE9 622 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms