RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 VIPR2P41587 438 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SUSD1Q6UWL2 747 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LINC00471Q8N535 108 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR6N1Q8NGY5 312 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ARMC5Q96C12 935 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLC2A13Q96QE2 648 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 AKTIPQ9H8T0 292 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 AGPSO00116 658 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 GATBO75879 557 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RCBTB2O95199 551 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FHP07954 510 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 HNF1BP35680 557 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SYVN1Q86TM6 617 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR2L5Q8NG80 312 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MARK1Q9P0L2 795 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PADI2Q9Y2J8 665 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IFT172Q9UG01 1749 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 C9P02748 559 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CDH1P12830 882 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IL12AP29459 219 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CASP6P55212 293 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 C1orf61Q13536 156 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TGFBIQ15582 683 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TICAM1Q8IUC6 712 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PQLC3Q8N755 202 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IL21RQ9HBE5 538 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CENPMQ9NSP4 180 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 BTN3A3O00478 584 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TNFRSF10BO14763 440 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 DLX3O60479 287 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PFKLP17858 780 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FECHP22830 423 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 BNIP1Q12981 228 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CST6Q15828 149 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR5K1Q8NHB7 308 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CGREF1Q99674 301 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ASPNQ9BXN1 380 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLC6A9P48067 706 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 HTRA3P83110 453 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CDK6Q00534 326 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CREB5Q02930 508 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FITM2Q8N6M3 262 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 DKKL1Q9UK85 242 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MYOM1P52179 1685 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 H7BY64 318 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZBTB22O15209 634 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TSPAN5P62079 268 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ABATP80404 500 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 DMPKQ09013 629 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 FAM3CQ92520 227 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 A6NCN8 305 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF20P17024 532 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 HERC3Q15034 1050 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CD244Q9BZW8 370 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ING4Q9UNL4 249 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF3P17036 446 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SELENOVP59797 346 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RAB26Q9ULW5 256 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms