RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 BNIPLQ7Z465 357 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PDZD3Q86UT5 571 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CNTD1Q8N815 330 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAML1Q92585 1016 aa4.28□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 G3V3Y1 287 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 J3QKU1 62 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PEX1O43933 1283 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL18O94889 574 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 RPA4Q13156 261 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CEP97Q8IW35 865 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 SCAIQ8N9R8 606 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LRRK2Q5S007 2527 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FEZF1A0PJY2 475 aa4.27□□□□□ -1.73
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