RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 STEAP4Q687X5 459 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 CUZD1Q86UP6 607 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDIK1LQ8N165 341 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPATCH11Q8N954 259 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 PARVBQ9HBI1 364 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF160Q9HCG1 818 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 NTNG1Q9Y2I2 539 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSAT1Q9Y617 370 aa21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 FEZF1A0PJY2 475 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 C8GP07360 202 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC26A3P40879 764 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSNK1G2P78368 415 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 NAE1Q13564 534 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC138Q96M89 665 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 IDSB3KWA1 339 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF224P0DH78 156 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 COX6A1P12074 109 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACPPP15309 386 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 FDXRP22570 491 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 RELAQ04206 551 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 SP140Q13342 867 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATG9BQ674R7 924 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 Q6ZS92 163 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALNT7Q86SF2 657 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 PYCR2Q96C36 320 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 MVB12AQ96EY5 273 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRC3Q9H069 523 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 BLACEA4D250 179 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP2K7O14733 419 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA7AO75326 666 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 JRKO75564 520 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 HPP00738 406 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 CELA2AP08217 269 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH1P12830 882 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCL6P41182 706 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 EMP2P54851 167 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRB2Q5IJ48 1285 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 IQCKQ8N0W5 287 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZADH2Q8N4Q0 377 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNF8Q96H20 258 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT12Q99456 494 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 SGPP1Q9BX95 441 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 LHPPQ9H008 270 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX24Q9Y343 169 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC16A5O15375 505 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIAS1O75925 651 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL18O94889 574 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARL4CP56559 192 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL2P60568 153 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF460Q14592 562 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGFL2Q6UWQ7 119 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 C17orf64Q86WR6 236 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR4K3Q96R72 315 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 VWA7Q9Y334 891 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC188H7C350 402 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANXA5P08758 320 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPPBP16860 134 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL1RNP18510 177 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 NR6A1Q15406 480 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF25-201ENST00000348333 LINC00696Q6ZRV3 163 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms