RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PRKCGP05129 697 aa16.14■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 CD1DP15813 335 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GABRB3P28472 473 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CNTN1Q12860 1018 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 IFI44LQ53G44 452 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.14■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.14■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FTMTQ8N4E7 242 aa16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GPR156Q8NFN8 814 aa16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 MIOSQ9NXC5 875 aa16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 CBLBQ13191 982 aa16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.13■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 MND1Q9BWT6 205 aa16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.13■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 SOX14O95416 240 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RLN1P04808 185 aa16.12■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 SOX3P41225 446 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 OR4D1Q15615 310 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 CHST13Q8NET6 341 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 OR2A25A4D2G3 310 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FABP7O15540 132 aa16.12■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FAM189BP81408 668 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TSC22D1Q15714 1073 aa16.12■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 TRBC1P01850 177 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 MAGEA12P43365 314 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CLCNKBP51801 687 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GHRHRQ02643 423 aa16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 OR2T35Q8NGX2 323 aa16.12■□□□□ 0.17
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