RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 SCN2AQ99250 2005 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 A0A1W2PRQ8 180 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CLIC1O00299 241 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 INSIG1O15503 277 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FFAR2O15552 330 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CHIT1Q13231 466 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SAMD12Q8N8I0 201 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 K7EPI3 171 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CDK2P24941 298 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 KLRK1P26718 216 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TESCQ96BS2 214 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TFPIP10646 304 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TOMM20Q15388 145 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ARL11Q969Q4 196 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GPR22Q99680 433 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 POLLQ9UGP5 575 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PAHP00439 452 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CMPK1P30085 196 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GRIK2Q13002 908 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 F5P12259 2224 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 LRRC37A3O60309 1634 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FLRT2O43155 660 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 LY6KQ17RY6 165 aa16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PI15O43692 258 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 DNASE1P24855 282 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 IL12BP29460 328 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NFKB2Q00653 900 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RGMAQ96B86 450 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 A0A075B6Q4 140 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MSCO60682 206 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 DERL2Q9GZP9 239 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GXYLT2A0PJZ3 443 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 B3GALT2O43825 422 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SCN2BO60939 215 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 H3BUI4 141 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ADAMTS3O15072 1205 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PPM1BO75688 479 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EMX2Q04743 252 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF675Q8TD23 568 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 LGR5O75473 907 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ARL14Q8N4G2 192 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 COQ8BQ96D53 544 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 OR4K3Q96R72 315 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 UCK2Q9BZX2 261 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PRAF2O60831 178 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MALT1Q9UDY8 824 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 WDR18Q9BV38 432 aa16.48■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 CDRT1O95170 752 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SOX9P48436 509 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 MTFR1LQ9H019 292 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 SCNN1GP51170 649 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 RAB19A4D1S5 217 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 AMD1P17707 334 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 NMBRP28336 390 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ST3GAL4Q11206 333 aa16.47■□□□□ 0.23
HCN1-201ENST00000303230 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms