RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 PROM1O43490 865 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJB2P25686 324 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 MARCH9Q86YJ5 346 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ACER1Q8TDN7 264 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM2Q99965 735 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF32Q9H0A6 362 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 IRF6O14896 467 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 MATN4O95460 622 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF404Q494X3 552 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 NSMAFQ92636 917 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 CLDN4O14493 209 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKCGP05129 697 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 DPYSL3Q14195 570 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 PXMP2Q9NR77 195 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 NUDT17P0C025 328 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 COL6A1P12109 1028 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 GABRB2P47870 512 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF132P52740 706 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC2A8Q9NY64 477 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 AGPSO00116 658 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 LAMP2P13473 410 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 EDNRAP25101 427 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTA2P62736 377 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTG2P63267 376 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTC1P68032 377 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTA1P68133 377 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM117BQ6P1L5 589 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 CDT1Q9H211 546 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF6Q9Y252 685 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 MAKP20794 623 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 THPOP40225 353 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 SNTA1Q13424 505 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ARMC12Q5T9G4 340 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 GLB1LQ6UWU2 654 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 ZER1Q7Z7L7 766 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 RAET1EQ8TD07 263 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 HYLS1Q96M11 299 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 C17orf62Q9BQA9 187 aa10.9□□□□□ -0.66
HDGFL3-201ENST00000299633 H3BSA7 217 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC23AQ15436 765 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 NEPROQ6NW34 567 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 IL17RBQ9NRM6 502 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 TOX4O94842 621 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 TSHRP16473 764 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.9□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 CDH8P55286 799 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 TBX4P57082 545 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 GRB2P62993 217 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 CHST9Q7L1S5 443 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 EBF2Q9HAK2 575 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ABCB8Q9NUT2 735 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 NDUFA6P56556 154 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 HERVK_113P63132 956 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 GRIK2Q13002 908 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 CHST13Q8NET6 341 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 OMDQ99983 421 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SPG21Q9NZD8 308 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 CTSEP14091 401 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ELP5Q8TE02 316 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SPDEFO95238 335 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC1A5Q15758 541 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 NAT16Q8N8M0 369 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP6AP2O75787 350 aa10.89□□□□□ -0.67
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms