RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PHKG1Q16816 387 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ISXQ2M1V0 245 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PHF19Q5T6S3 580 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ANKS6Q68DC2 871 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SBSNQ6UWP8 590 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C16orf89Q6UX73 402 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CHSY3Q70JA7 882 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FRA10AC1Q70Z53 315 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 STOML1Q9UBI4 398 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KLHL3Q9UH77 587 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 POMT2Q9UKY4 750 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PIPSLA2A3N6 862 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF839A8K0R7 811 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C2orf74A8MZ97 194 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KLK8O60259 260 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SUPT3HO75486 399 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PSMG1O95456 288 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SLC16A8O95907 504 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ERGP11308 486 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CCKBRP32239 447 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HSD17B2P37059 387 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AP1S2P56377 157 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ACTR3P61158 418 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MAPRE2Q15555 327 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CYP2A13Q16696 494 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PFKFB4Q16877 469 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC138Q96M89 665 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ARL15Q9NXU5 204 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 OARD1Q9Y530 152 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.49□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TLCD2A6NGC4 264 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM233B4DJY2 109 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UBXN8O00124 270 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 FKBP6O75344 327 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 GUCA1CO95843 209 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 UGT2B7P16662 529 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ITGAXP20702 1163 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ATP4BP51164 291 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 PNLIPRP1P54315 467 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CDC16Q13042 620 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SQLEQ14534 574 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 KIR2DS3Q14952 304 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 AAGABQ6PD74 315 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF480Q8WV37 535 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 EXT2Q93063 718 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CATSPER2Q96P56 530 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 CD180Q99467 661 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 SERPINI1Q99574 410 aa11.48□□□□□ -0.57
C16orf46-201ENST00000299578 STRADBQ9C0K7 418 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms