RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.91■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.91■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 DTNAQ9Y4J8 743 aa21.91■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPV9 198 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 DHRS12A0PJE2 317 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS38A1L453 326 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK2P16519 638 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B2P37059 387 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 KIR3DL1P43629 444 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F3Q08477 520 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 MTAPQ13126 283 aa21.9■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 HKDC1Q2TB90 917 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZS52 159 aa21.9■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 OR10A6Q8NH74 314 aa21.9■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 XKR8Q9H6D3 395 aa21.9■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.9■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.89■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.89■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.89■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PHACTR4Q8IZ21 702 aa21.89■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SMPDL3AQ92484 453 aa21.89■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PDXPQ96GD0 296 aa21.89■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 ARMC1Q9NVT9 282 aa21.89■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 EBF1Q9UH73 591 aa21.89■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 A0A096LPI6 279 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV5S2A0A599 114 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 FPGTO14772 594 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT3O60678 531 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GBAP04062 536 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 COX7A2P14406 83 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 CYP51A1Q16850 503 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GLYATQ6IB77 296 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM69Q86WT6 500 aa21.89■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.89■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR1E3Q8WZA6 343 aa21.89■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 PCM1Q15154 2024 aa21.89■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 WNT3P56703 355 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1024LP59773 190 aa21.88■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TBCELQ5QJ74 424 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 MIEF2Q96C03 454 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.88■■□□□ 1.09
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VSTM4-201ENST00000298454 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2E3Q969T4 207 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 OR2M4Q96R27 311 aa21.88■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 YY2O15391 372 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 SCN2BO60939 215 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 LAMP1P11279 417 aa21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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