RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294543.10

TMCO4-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO4, Length 2,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4-201ENST00000294543 MALT1Q9UDY8 824 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CMAHPQ9Y471 501 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 KLK4Q9Y5K2 254 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PLXNB2O15031 1838 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 MYLKQ15746 1914 aa10.66□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 MUSKO15146 869 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FABP7O15540 132 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 RFPL3O75679 317 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 GPX5O75715 221 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 RETP07949 1114 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CPT1AP50416 773 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CLCN7P51798 805 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PSPHP78330 225 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 GRB14Q14449 540 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ZBTB6Q15916 424 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 KLHL12Q53G59 568 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 WNT8BQ93098 351 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 DDIT4Q9NX09 232 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 SIRT5Q9NXA8 310 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FAM50BQ9Y247 325 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FCER2P06734 321 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FPR1P21462 350 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 MAP2K6P52564 334 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 CSNK2BP67870 215 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ZNF33BQ06732 778 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 AP5B1Q2VPB7 878 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ZNF284Q2VY69 593 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 XKR7Q5GH72 579 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 NOTUMQ6P988 496 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 Q6ZSR9 355 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 UNC93AQ86WB7 457 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 RNF130Q86XS8 419 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ACTL8Q9H568 366 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 REEP1Q9H902 201 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 GLOD4Q9HC38 313 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 RDH8Q9NYR8 311 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ZNF225Q9UK10 706 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa10.65□□□□□ -0.7
TMCO4-201ENST00000294543 ARNTLO00327 626 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 GFRA2O00451 464 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 PLA2G10O15496 165 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 ATG13O75143 517 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 PPM1BO75688 479 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 PROS1P07225 676 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 MMP3P08254 477 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 SLC2A4P14672 509 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 MAP2K3P46734 347 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 HTR6P50406 440 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 GEMP55040 296 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 ITKQ08881 620 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 RPA4Q13156 261 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 GRM7Q14831 915 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 ANGPT1Q15389 498 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 CCL14Q16627 93 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 TRIQKQ629K1 86 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 C10orf111Q8N326 155 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 METTL6Q8TCB7 284 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 ST8SIA4Q92187 359 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 RNF34Q969K3 372 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 SENP8Q96LD8 212 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 QRFPRQ96P65 431 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.65□□□□□ -0.71
TMCO4-201ENST00000294543 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms