RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RAB33BQ9H082 229 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KCNK13Q9HB14 408 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 IGF2RP11717 2491 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ADAMTS20P59510 1910 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.45■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM233B4DJY2 109 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DUX1O43812 170 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 OR4F21O95013 312 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 OTCP00480 354 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PVRP15151 417 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 HK2P52789 917 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FOXA1P55317 472 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CHIT1Q13231 466 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DOC2AQ14183 400 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 IRGCQ6NXR0 463 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 WDR34Q96EX3 536 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ERICH4A6NGS2 130 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ESRRBO95718 433 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SQSTM1Q13501 440 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 XKR6Q5GH73 641 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ATG9BQ674R7 924 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 WDR48Q8TAF3 677 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 AGR3Q8TD06 166 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TGM7Q96PF1 710 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DPH7Q9BTV6 452 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ACTR8Q9H981 624 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.44■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 H7BY64 318 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MATN2O00339 956 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CLGNO14967 610 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PRAMEF10O60809 474 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CPNE6O95741 557 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MAGP20916 626 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CMPK1P30085 196 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GRIA3P42263 894 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CASP2P42575 452 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PKNOX1P55347 436 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ABATP80404 500 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 IRF8Q02556 426 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 DMTNQ08495 405 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF425Q6IV72 752 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FAM129CQ86XR2 697 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 STON2Q8WXE9 905 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PNPOQ9NVS9 261 aa21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 A0A0J9YY10 115 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CLDN9O95484 217 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 C9P02748 559 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EBLN1P0CF75 366 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CSNK1G2P78368 415 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CYP4F3Q08477 520 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TBCCQ15814 346 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ZIC1Q15915 447 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 FCRL6Q6DN72 434 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CLEC6AQ6EIG7 209 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 MAP3K3Q99759 626 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 EHD1Q9H4M9 534 aa21.42■■□□□ 1.02
FAM53B-201ENST00000280780 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms