RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258062.9

REPS1-201, Transcript of RALBP1 associated Eps domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REPS1, Length 3,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1-201ENST00000258062 TPGS2Q68CL5 300 aa15.88■□□□□ 0.13
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REPS1-201ENST00000258062 KCNC2Q96PR1 638 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 FZD4Q9ULV1 537 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 VIPP01282 170 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 CKMP06732 381 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 SRCP12931 536 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.88■□□□□ 0.13
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REPS1-201ENST00000258062 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.88■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 PGBD3Q8N328 593 aa15.88■□□□□ 0.13
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REPS1-201ENST00000258062 LHX8Q68G74 356 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 21.1
REPS1-201ENST00000258062 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 PROX1Q92786 737 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 FOXJ1Q92949 421 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 C7orf34Q96L11 122 aa15.86■□□□□ 0.13
REPS1-201ENST00000258062 DACH2Q96NX9 599 aa15.86■□□□□ 0.13
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