RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 LEFTY1O75610 366 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PGRP06401 933 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 S100GP29377 79 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GJA5P36382 358 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HMGCS1Q01581 520 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MANEALQ5VSG8 457 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM198Q66K66 360 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR2T29Q8NH02 315 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C5orf34Q96MH7 638 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CMTM6Q9NX76 183 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KAT6AQ92794 2004 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C9JVG2 144 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR5F1O95221 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C7P10643 843 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ABATP80404 500 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RHDQ02161 417 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AHSA2Q719I0 299 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR52J3Q8NH60 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GPR151Q8TDV0 419 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HMGB4Q8WW32 186 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GLYATL1Q969I3 302 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HBEGFQ99075 208 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PSAT1Q9Y617 370 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLX4Q8IY92 1834 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM233B4DJY2 109 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SOX30O94993 753 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RENP00797 406 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 G6PDP11413 515 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OXTRP30559 389 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GRIA2P42262 883 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GSK3BP49841 420 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MOGSQ13724 837 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO43Q4G163 708 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAB41Q5JT25 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KBTBD6Q86V97 674 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SNX33Q8WV41 574 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KLK6Q92876 244 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MGME1Q9BQP7 344 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 REEP4Q9H6H4 257 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HHATLQ9HCP6 504 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NENFQ9UMX5 172 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 DRGXA6NNA5 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD11O00231 422 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TAF4O00268 1085 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACVR2AP27037 513 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 XKP51811 444 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AP3S2P59780 193 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 BTN3A2P78410 334 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LIN54Q6MZP7 749 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ING4Q9UNL4 249 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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