RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CPZ	Q66K79	652 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL35	Q6PF15	583 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TPD52L3	Q96J77	140 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	KPNA5	O15131	536 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PFDN1	O60925	122 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK5	O95279	499 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP5	P24593	272 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NNMT	P40261	264 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WNT3	P56703	355 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ISL1	P61371	349 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TTC23L	Q6PF05	361 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CHPF	Q8IZ52	775 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAL2	Q969L2	176 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL8	Q96CD0	374 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	USE1	Q9NZ43	259 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BCKDK	O14874	412 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A5	O15375	505 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SCN2B	O60939	215 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RHO	P08100	348 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GSTM1	P09488	218 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PRPH2	P23942	346 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	METAP1	P53582	386 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	VLDLR	P98155	873 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GSTM4	Q03013	218 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	EPS8	Q12929	822 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	VMAC	Q2NL98	169 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	LIPJ	Q5W064	366 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	AP2M1	Q96CW1	435 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DOK1	Q99704	481 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	XYLB	O75191	536 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MOSPD3	O75425	235 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TFPT	P0C1Z6	253 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ELFN1	P0C7U0	828 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CCNA2	P20248	432 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FSHR	P23945	695 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G16	P53816	162 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RAD23A	P54725	363 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CREM	Q03060	361 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NRBF2	Q96F24	287 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BAG5	Q9UL15	447 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SLC1A7	O00341	560 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SYN1	P17600	705 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FMO3	P31513	532 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	KDELR2	P33947	212 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NFATC3	Q12968	1075 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MTAP	Q13126	283 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA11	Q86U17	422 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PARP8	Q8N3A8	854 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T29	Q8NH02	315 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GLYATL1	Q969I3	302 aa		12.65	□□□□□ -0.38

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