RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DOCK7	Q96N67	2140 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		E9PQ18	207 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MSTN	O14793	375 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RBP3	P10745	1247 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNJ5	P48544	419 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	JAM2	P57087	298 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK17	Q00537	523 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CARTPT	Q16568	116 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC14	Q49A88	953 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PMF1	Q6P1K2	205 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM205	Q6UW68	189 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	EMC1	Q8N766	993 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2M7	Q8NG81	312 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	UCN3	Q969E3	161 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC58	Q96CX6	371 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP2	Q9H0W7	228 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP25	Q9NPA2	562 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DEPP	Q9NTK1	212 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM187A	A6NFU0	413 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf74	A8MZ97	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FCHO1	O14526	889 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MED26	O95402	600 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	THBD	P07204	575 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PTN	P21246	168 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	IL2RG	P31785	369 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NTF4	P34130	210 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP4	P49662	377 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CHN2	P52757	468 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	EFNA4	P52798	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD23B	P54727	409 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RAG2	P55895	527 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NME3	Q13232	169 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ALCAM	Q13740	583 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	STIL	Q15468	1287 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC14A2	Q15849	920 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZIC1	Q15915	447 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	AGAP6	Q5VW22	663 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	GK5	Q6ZS86	529 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MDGA2	Q7Z553	956 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		5.7	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms