RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	DSTN	P60981	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	SLIT1	O75093	1534 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	BMP8B	P34820	402 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	MTPN	P58546	118 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672		J3QLW9	94 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PLD2	O14939	933 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	ALOX15B	O15296	676 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF19	P17023	458 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	GNG2	P59768	71 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	DCDC1	P59894	354 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	TLE2	Q04725	743 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NRXN1-222	ENST00000625672	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MAFK	O60675	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FCER2	P06734	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IRF7	Q92985	503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NODAL	Q96S42	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IRAK2	O43187	625 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VEGFD	O43915	354 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BCHE	P06276	602 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NRP1	O14786	923 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ALPI	P09923	528 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GNRHR	P30968	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF84	P51523	738 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SPIN4	Q56A73	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ADH1B	P00325	375 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VIPR1	P32241	457 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DEFA5	Q01523	94 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TEAD2	Q15562	447 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672		Q6ZVU0	165 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HMGN1	P05114	100 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BDKRB1	P46663	353 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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