RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PPP6C	O00743	305 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IRAK2	O43187	625 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN6	O43657	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TOX	O94900	526 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TNNC2	P02585	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PRR35	P0CG20	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	FGF5	P12034	268 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IDE	P14735	1019 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CD58	P19256	250 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KEL	P23276	732 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RRM1	P23921	792 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CXCR3	P49682	368 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PEX5	P50542	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF81	P51508	661 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PDE1B	Q01064	536 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PMP22	Q01453	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GPS2	Q13227	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	NFATC2	Q13469	925 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RAB32	Q13637	225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DDB2	Q92466	427 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768		O00370	1275 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN4	O14493	209 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCP110	O43303	1012 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	LDB2	O43679	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SNAP91	O60641	907 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GCNT3	O95395	438 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ERBB2	P04626	1255 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GAP43	P17677	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CMA1	P23946	247 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GK	P32189	559 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	STK4	Q13043	487 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IL11RA	Q14626	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.68	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms