RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPIN4Q56A73 249 aa28.06■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC13A3Q8WWT9 602 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB123Q8N688 67 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM168Q9H0V1 697 aa28.02■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AK4P27144 223 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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