RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 SLC14A1Q13336 389 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 TUBA3CQ13748 450 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 HS3ST5Q8IZT8 346 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 ARL10Q8N8L6 244 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 OR13F1Q8NGS4 319 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 OR4K3Q96R72 315 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 PKP4Q99569 1192 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 SGK2Q9HBY8 427 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 GMEB1Q9Y692 573 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 NPC1O15118 1278 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 XYLBO75191 536 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 ITGAMP11215 1152 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 H3BMQ9 156 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 ACOX1Q15067 660 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 GPR107Q5VW38 600 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 MAGED4Q96JG8 741 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.59■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 SEMG1P04279 462 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-207ENST00000565975 GSTM2P28161 218 aa21.58■■□□□ 1.05
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SPNS1-207ENST00000565975 SEC14L2O76054 403 aa21.57■■□□□ 1.04
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SPNS1-207ENST00000565975 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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SPNS1-207ENST00000565975 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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SPNS1-207ENST00000565975 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 PTOV1Q86YD1 416 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-207ENST00000565975 OR7G3Q8NG95 312 aa21.57■■□□□ 1.04
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