RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		2.68	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM221	A6NGB7	291 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DUXA	A6NLW8	204 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF716	A6NP11	495 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PI62	339 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOD	O00212	210 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFS8	O00217	210 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HS3ST1	O14792	307 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK13	O15264	365 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FLRT2	O43155	660 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F6	O75461	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ECI2	O75521	394 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAG2	O75638	210 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PAH	P00439	452 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF735	P0CB33	412 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CALCB	P10092	127 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ETFA	P13804	333 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR2A	P28223	471 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN6	P29350	595 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PKLR	P30613	574 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR1	P32246	355 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RFC2	P35250	354 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD17B3	P37058	310 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NPBWR1	P48145	328 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LHX1	P48742	406 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NUMB	P49757	651 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD1	P49961	510 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2J2	P51589	502 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRX1	P54821	245 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTR3	P61158	418 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IRX4	P78413	519 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF17	Q02223	184 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIK2	Q13002	908 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE2B	Q13066	116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NAE1	Q13564	534 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT3	Q14435	633 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PDIA5	Q14554	519 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MELK	Q14680	651 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	STK11	Q15831	433 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE2E	Q4V326	116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG10	Q5BKT4	473 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LCN10	Q6JVE6	187 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB2	Q8N680	514 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GJC3	Q8NFK1	279 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52J3	Q8NH60	311 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MOB3A	Q96BX8	217 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF183	Q96D59	192 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf60	Q96EN9	201 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA33	Q96N06	139 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PSKH2	Q96QS6	385 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	USP28	Q96RU2	1077 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NUF2	Q9BZD4	464 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PANK4	Q9NVE7	773 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98

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