RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GPHN-215	ENST00000557654	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GPHN-215	ENST00000557654	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DFFB	O76075	338 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MNDA	P41218	407 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TPM4	P67936	248 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	HERC3	Q15034	1050 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MAF1	Q9H063	256 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73	1e-6	■■■□□ 19
GPHN-215	ENST00000557654	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MSH6	P52701	1360 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ATP7B	P35670	1465 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CTAGE5	O15320	804 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TPM1	P09493	284 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CDH3	P22223	829 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MPZ	P25189	248 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	OPRL1	P41146	370 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	GSDMD	P57764	484 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ENPP2	Q13822	863 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	E2F5	Q15329	346 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CA9	Q16790	459 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654		Q6ZRP5	223 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DHX58	Q96C10	678 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	EGFL8	Q99944	293 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PTPRM	P28827	1452 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	FIBP	O43427	364 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ADAM20	O43506	726 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DCX	O43602	365 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CCZ1B	P86790	482 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DRP2	Q13474	957 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	NPAT	Q14207	1427 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GPHN-215	ENST00000557654	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73

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