RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555929.1

PCNX4-211, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-211ENST00000555929 FOXM1Q08050 763 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CYP4F3Q08477 520 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CHIT1Q13231 466 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 KCNAB1Q14722 419 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CHI3L2Q15782 390 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 UNC50Q53HI1 259 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 LIPMQ5VYY2 423 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FAM129CQ86XR2 697 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PLD3Q8IV08 490 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 NEIL2Q969S2 332 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 RNF31Q96EP0 1072 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TMEM74Q96NL1 305 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CDK15Q96Q40 435 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 OR4K3Q96R72 315 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 STRADBQ9C0K7 418 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ACTR8Q9H981 624 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PDE7BQ9NP56 450 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PCTPQ9UKL6 214 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.29□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FEZF1A0PJY2 475 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 EFCAB7A8K855 629 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 E2F3O00716 465 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PPP6CO00743 305 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 HAT1O14929 419 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 BIRC5O15392 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SIAH2O43255 324 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 OR1F1O43749 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 NRP2O60462 931 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 C9P02748 559 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 STATHP02808 62 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 EBLN1P0CF75 366 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 THRAP10827 490 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PCNAP12004 261 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PIK3CGP48736 1102 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 MAPK10P53779 464 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 DNAJB13P59910 316 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SH3BP2P78314 561 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 HSD11B2P80365 405 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 NFKB2Q00653 900 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CLCQ05315 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SQSTM1Q13501 440 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 DOC2AQ14183 400 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ZIC1Q15915 447 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ISXQ2M1V0 245 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SGO1Q5FBB7 561 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FCRL6Q6DN72 434 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 KRT78Q8N1N4 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CCT6BQ92526 530 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 TCTN2Q96GX1 697 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 CD180Q99467 661 aa7.28□□□□□ -1.24
PCNX4-211ENST00000555929 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms