RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549101.1

USP15-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-211ENST00000549101 PROX1Q92786 737 aa4.6□□□□□ -1.67
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USP15-211ENST00000549101 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 NYXQ9GZU5 481 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 RPS6KA5O75582 802 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 KRT33AO76009 404 aa4.59□□□□□ -1.67
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USP15-211ENST00000549101 CPT2P23786 658 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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USP15-211ENST00000549101 HDAC11Q96DB2 347 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-211ENST00000549101 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
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USP15-211ENST00000549101 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.58□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 ACADSP16219 412 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 SLC8A3P57103 927 aa4.58□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 PCGF5Q86SE9 256 aa4.58□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.58□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 C2orf48Q96LS8 159 aa4.58□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.57□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 SPSB1Q96BD6 273 aa4.57□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.56□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 TOMM20Q15388 145 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 CST9LP1Q5W188 147 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 SPINK14Q6IE38 97 aa4.56□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 FCRLAQ7L513 359 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 MFN1Q8IWA4 741 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 Q8N377 158 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.56□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 ZNF558Q96NG5 402 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.56□□□□□ -1.68
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USP15-211ENST00000549101 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.56□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 UBE2CO00762 179 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 BAG3O95817 575 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 FYNP06241 537 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 KRTAP10-3P60369 221 aa4.55□□□□□ -1.68
USP15-211ENST00000549101 DLK1P80370 383 aa4.55□□□□□ -1.68
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