RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 ERV3-1Q14264 604 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IP6K3Q96PC2 410 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FMO2Q99518 471 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR54Q9H977 334 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 HYKKA2RU49 373 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 H0YGG7 62 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 NRP2O60462 931 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ITGAXP20702 1163 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PHBP35232 272 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB10P61026 200 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP6V0D1P61421 351 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SSPNQ14714 243 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 MUM1Q2TAK8 710 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 C16orf46Q6P387 395 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PPM1NQ8N819 430 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF31Q96EP0 1072 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CYTH2Q99418 400 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FASNP49327 2511 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 C1QL1O75973 258 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PRKAR1AP10644 381 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CSNK1G2P78368 415 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM53BQ14153 422 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF460Q14592 562 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 C17orf64Q86WR6 236 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OR2Y1Q8NGV0 311 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 STARD5Q9NSY2 213 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 H7BY64 318 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC7O00311 574 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 ANXA5P08758 320 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 CRABP2P29373 138 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 GGT5P36269 586 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PMS2P54278 862 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 POLE2P56282 527 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IL10RAQ13651 578 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 LY6DQ14210 128 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PTERQ96BW5 349 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4K3Q96R72 315 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SEMA4CQ9C0C4 833 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTDSP2-203ENST00000547701 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CD1DP15813 335 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SAT1P21673 171 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 COX15Q7KZN9 410 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF843Q8N446 348 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1191Q96A73 305 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 C10orf90Q96M02 699 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC14CA4D256 554 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 HAT1O14929 419 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC166P0CW27 439 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ALAS2P22557 587 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC6A12P48065 614 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLMAPQ14BN4 828 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TGFBIQ15582 683 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TSNQ15631 228 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 C1orf189Q5VU69 101 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 IFT20Q8IY31 132 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms