RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 MYO6Q9UM54 1294 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 CDC14AQ9UNH5 594 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ANK2Q01484 3957 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 OR2A25A4D2G3 310 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 C5orf60A6NFR6 353 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 C2orf81A6NN90 581 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 H0YGG7 62 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 MYO1FO00160 1098 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 CYP1A2P05177 515 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ITGALP20701 1170 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 UBXN1Q04323 297 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 HKDC1Q2TB90 917 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 Q5PR19 223 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ANKRD37Q7Z713 158 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 VRK3Q8IV63 474 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 PIANPQ8IYJ0 282 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 LGI4Q8N135 537 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 POGLUT1Q8NBL1 392 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 ELMO1Q92556 727 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 CABS1Q96KC9 395 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 Q96MF0 132 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 CDCP1Q9H5V8 836 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 FAM169AQ9Y6X4 670 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-208ENST00000547298 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 A0A0U1RQJ8 604 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PPV9 198 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 I3L1I5 382 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 PRMT3O60678 531 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 AP2A2O94973 939 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SKILP12757 684 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ACVR2AP27037 513 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 MC4RP32245 332 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ADRA1AP35348 466 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ARHGAP25P42331 645 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TYRO3Q06418 890 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 MPP3Q13368 585 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 DBN1Q16643 649 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 GPR33Q49SQ1 333 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 RANBP10Q6VN20 620 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ZNF567Q8N184 647 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 OR2L3Q8NG85 312 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 OR2A1Q8NGT9 310 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 METTL21AQ8WXB1 218 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SLCO2A1Q92959 643 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 MIPEPQ99797 713 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SH3GL2Q99962 352 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ZANQ9Y493 2812 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 KRT87PA6NCN2 255 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TRIM64BA6NI03 449 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ZNF487B1APH4 448 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 NPIPA2E9PIF3 369 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 NPIPA3F8WFD2 350 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 CDK2AP1O14519 115 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 APOL1O14791 398 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 FKBP9O95302 570 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TPM2P07951 284 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ITGA8P53708 1063 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 EXT1Q16394 746 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SLC5A8Q8N695 610 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 OR5M9Q8NGP3 310 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ELP5Q8TE02 316 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TMEM125Q96AQ2 219 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 APOL2Q9BQE5 337 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 SARGQ9BW04 601 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-208ENST00000547298 ARHGEF33A8MVX0 844 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms