RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524927.1

NEDD8-203, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NEDD8, Length 653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-203ENST00000524927 WDR47O94967 919 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 IGLV3-27P01718 113 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CCNB1P14635 433 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FASLGP48023 281 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FHL3Q13643 280 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CSHL1Q14406 222 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 IRF4Q15306 451 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RAB43Q86YS6 212 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CNDP1Q96KN2 507 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TAAR6Q96RI8 345 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ALG8Q9BVK2 526 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ABI3Q9P2A4 366 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TOXO94900 526 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ZNF202O95125 648 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ONECUT2O95948 504 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TPOP07202 933 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FAM157CP0CG43 387 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TMEM225BP0DP42 221 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 PDGFRAP16234 1089 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 KELP23276 732 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ADORA2BP29275 332 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 GDF5P43026 501 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 GSTM5P46439 218 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 DCAF7P61962 342 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 DMTNQ08495 405 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.343e-7■■□□□ 13.3
NEDD8-203ENST00000524927 FOXE3Q13461 319 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 PTPRRQ15256 657 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RPS6KA2Q15349 733 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 BTBD16Q32M84 506 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 P3H2Q8IVL5 708 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FBXL16Q8N461 479 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RNF139Q8WU17 664 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 PATE1Q8WXA2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TFAP2BQ92481 460 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NCSTNQ92542 709 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 WASF1Q92558 559 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RSC1A1Q92681 617 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 MLST8Q9BVC4 326 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NLNQ9BYT8 704 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FGF22Q9HCT0 170 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TMEM202A6NGA9 273 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CLDN4O14493 209 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 STX6O43752 255 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 PRAMEF2O60811 474 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NXPH3O95157 252 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NR2F6P10588 404 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 SRCP12931 536 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 HTR7P34969 479 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 KRT2P35908 639 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 FOLR3P41439 243 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ZNF131P52739 623 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 PNLIPRP1P54315 467 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 KIAA1024LP59773 190 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 BMPR2Q13873 1038 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ACOX1Q15067 660 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 RRAGAQ7L523 313 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 MRGPREQ86SM8 312 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 NRROSQ86YC3 692 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 EID3Q8N140 333 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-203ENST00000524927 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.67□□□□□ -1.34
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