RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXC2	Q99958	501 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	VPS16	Q9H269	839 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	COPG2	Q9UBF2	871 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636		H3BUI4	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636		O00370	1275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNN4	O15554	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CYTIP	O60759	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SPAG6	O75602	509 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MT-ND5	P03915	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	UBL4A	P11441	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT5	P13647	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT4	P19013	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NFKBIA	P25963	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RPA1	P27694	616 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR1E	P28566	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	WNT5A	P41221	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC6A9	P48067	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	HK3	P52790	923 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	LILRA4	P59901	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCZ1B	P86790	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TLE4	Q04727	773 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DUSP8	Q13202	625 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PNOC	Q13519	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RIN1	Q13671	783 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	IRF3	Q14653	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CDSN	Q15517	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PERP	Q96FX8	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	LXN	Q9BS40	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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