RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517514.1

CLN8-202, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 4

Gene CLN8, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-202ENST00000517514 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 OPTCQ9UBM4 332 aa9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 BIRC5O15392 142 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ZW10O43264 779 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ITM2AO43736 263 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TRIM13O60858 407 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SUPT7LO94864 414 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 EBLN1P0CF75 366 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CDK4P11802 303 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CCL4P13236 92 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CHN1P15882 459 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 EPB42P16452 691 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 BGNP21810 368 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ETV5P41161 510 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 BCL6P41182 706 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 REEP5Q00765 189 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CLCQ05315 142 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CHIT1Q13231 466 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CAMK2BQ13554 666 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PHF19Q5T6S3 580 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ATG9BQ674R7 924 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 RNF44Q7L0R7 432 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SYVN1Q86TM6 617 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CCDC126Q96EE4 140 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CDK15Q96Q40 435 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 OR2A5Q96R48 311 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 NTMT1Q9BV86 223 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SARGQ9BW04 601 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 AICDAQ9GZX7 198 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 IPPKQ9H8X2 491 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 PELI2Q9HAT8 420 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 MED4Q9NPJ6 270 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FRYQ5TBA9 3013 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 KNTC1P50748 2209 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 FEZF1A0PJY2 475 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 P2RX6O15547 441 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 RASSF9O75901 435 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CCNDBP1O95273 360 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 MED26O95402 600 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CHRNGP07510 517 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 HGFP14210 728 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GNAZP19086 355 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 NR1D1P20393 614 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GCGRP47871 477 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 HSD11B2P80365 405 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 RELAQ04206 551 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GPR19Q15760 415 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 CHI3L2Q15782 390 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TBCCQ15814 346 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 KMT5CQ86Y97 462 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 RNF175Q8N4F7 328 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-202ENST00000517514 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms