RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516224.1

RNU6-311P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 311, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-311P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-311P-201ENST00000516224 LY6DQ14210 128 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TAB1Q15750 504 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRT39Q6A163 491 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 Q8NBF4 154 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 NUP37Q8NFH4 326 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 PROX1Q92786 737 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 HDAC11Q96DB2 347 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 CENPOQ9BU64 300 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 URADA6NGE7 173 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM50BP56557 158 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRIM29Q14134 588 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TOMM20Q15388 145 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 PTPN14Q15678 1187 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 KYNUQ16719 465 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TLK2Q86UE8 772 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPSB1Q96BD6 273 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 C2orf48Q96LS8 159 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 C5AR2Q9P296 337 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-311P-201ENST00000516224 A0A1W2PPR1 153 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 RPS6KA5O75582 802 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CEACAM4O75871 244 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 FYNP06241 537 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 ALDH1B1P30837 517 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 OR3A2P47893 321 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRTAP10-3P60369 221 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 IRX4P78413 519 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CST9LP1Q5W188 147 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CES4AQ5XG92 561 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRT74Q7RTS7 529 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 NYXQ9GZU5 481 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 IGSF1Q8N6C5 1336 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 PRKAR1AP10644 381 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 DLK1P80370 383 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 RAPSNQ13702 412 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 SUSD4Q5VX71 490 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPINK14Q6IE38 97 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 Q8N377 158 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPATA33Q96N06 139 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 ZNF558Q96NG5 402 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 AGAP4Q96P64 663 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 FZD8Q9H461 694 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 ACTL8Q9H568 366 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 NDE1Q9NXR1 346 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 MTMR11A4FU01 709 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 DIAPH2O60879 1101 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-311P-201ENST00000516224 BDNFP23560 247 aa3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms